Kiedy Charles proch 3 lata jego rodzice przeprowadzili się do Irlandii również zamieszkali 10 mil od momentu Dublina. Młody Napier wielokrotnie chorował, nie był za szczytny dodatkowo był krótkowidzem. 31 stycznia 1794 r. rozpoczął służbę w środku 33 regimencie (33rd Regiment), i poprzednio 8 maja otrzymał rangę porucznika 89 regimentu (89th Regiment). Później opuścił armię również pobierał nauki wewnątrz szkole w środku Celbridge. Podczas powstania irlandzkiego 1798 r. wapniak Charlesa ufortyfikował cztery kąty oraz rozdał uzbrojenie swoim pięciu synom. Sam z najstarszym objeżdżał okolicę prowadząc rozpoznanie. Rok od tego czasu Charles został adiutantem dowodzącego wojskami brytyjskimi w środku okręgu Limerick sir Jamesa Duffa.
Rok potem zrezygnował ze stanowiska również przyłączył się do formowanego właśnie do wnętrza Sussex 95. Regimentu (95th Regiment). Przez kolejne dwójka lata stacjonował z regimentem do wnętrza południowej Anglii. W 1803 r. został adiutantem swojego kuzyna, generała Henry'ego Edwarda Foxa, głównodowodzącego wojsk brytyjskich wewnątrz Irlandii. Później razem z generałem udał się do Londynu. 22 grudnia 1803 r. został awansowany do stopnia kapitana wewnątrz korpusie sztabowym. W 1804 r. rozpoczął służbę w środku Chatham dodatkowo Chelmsford. W tym samym roku zmarł jego wapniak pozostawiając rodzinę w środku złej sytuacji finansowej. Pomocną graba prezes rady ministrów William Pitt Młodszy, który ustanowił państwowe pensje na rzecz wdowy także jej córek. Synowie Napiera rozpoczęli kariery w środku wojsku. W połowie 1805 r. Napier został zatrudniony wewnątrz Hythe poniżej budowie kanału wojskowego.